Carta al editor

Emergencia del genotipo Cosmopolitan del virus dengue serotipo 2 (DENV2) en Madre de Dios, Perú, 2019

Emergence of the Cosmopolitan genotype of dengue virus serotype 2 (DENV2) in Madre de Dios, Peru, 2019

M. Paquita García ¹, Tecnólogo médico
Carlos Padilla ², biólogo molecular
Dana Figueroa ¹, biólogo molecular
Carlos Manrique ³, médico
César Cabezas ⁴, médico infectólogo tropicalista

¹  Laboratorio Nacional de Referencia de Metaxénicas Virales, Centro Nacional de Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Lima Perú.
²  Laboratorio Nacional de Referencia de Biología Molecular y Biotecnología, Centro Nacional de Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Lima Perú.
³  Dirección Ejecutiva de Epidemiología, Dirección Regional de Salud de Madre de Dios, Madre de Dios, Perú.
⁴  Centro Nacional de Salud Pública, Instituto Nacional de Salud, Lima Perú.

Sr. Editor.  El dengue es una enfermedad viral transmitida por el Aedes aegypti que se propaga cada vez más en las zonas tropicales y subtropicales. Hasta la semana epidemiológica 52 (diciembre) de 2019, se reportaron 3 139 335 casos de dengue en América con fallecidos (letalidad 0,049%), mientras que en el Perú en esa misma semana epidemiológica se han reportado 15 297casos de dengue, de los cuales el 76,0% correspondieron a las regiones Madre de Dios, Loreto, San Martín, Cajamarca y Tumbes. En la región de Madre de Dios se han reportado 4893 casos, 4,3 veces más que en 2018. De los 13 708 casos que se dieron en estas regiones, 3831 (78,3%) no mostraron signos de alarma, 1020 (20,8%) mostraron signos de alarma, 42 (0,86%), fueron graves y 18 murieron (0,37%) ⁽¹⁾.

El virus del dengue (DENV) comprende cuatro serotipos, y cada serotipo se divide a su vez en distintos genotipos. El aumento de la incidencia del dengue y la gravedad de la enfermedad se han asociado al cambio de los genotipos circulantes, así como a la evolución viral.

En la región de Madre de Dios, ubicada en la Amazonía peruana, los serotipos DENV1, DENV2, DENV3 y DENV4 han circulado desde 2014 ⁽²⁾. El objetivo del estudio fue mostrar la introducción de un nuevo genotipo de DENV 2, que no circula en las Américas.

Durante el brote de dengue en Madre de Dios, del año 2019, se hizo el diagnóstico inicial en los pacientes, determinando el antígeno NS1 por ELISA. El aislamiento viral en la línea celular C6-36 fue exitoso en 12 muestras de 32 procesadas. El virus fue identificado con anticuerpos monoclonales por inmunofluorescencia indirecta, y simultáneamente las muestras fueron analizadas por RT-PCR en tiempo real (qPCR-RT) en el Laboratorio de Referencia Nacional de Metaxénicas Virales del Instituto Nacional de Salud (INS). Todas las muestras fueron identificadas como DENV2.

Siguiendo el protocolo de Santiago et al. ⁽³⁾, los productos amplificados y purificados se secuenciaron por el método de Sanger en el Laboratorio de Biología Molecular del INS. Las secuencias obtenidas se ensamblaron utilizando el programa informático SeqScape para obtener la secuencia de consenso completa del gen E. Las secuencias completas del gen se utilizaron para realizar un análisis filogenético utilizando el programa informático MEGA X y el algoritmo Maximum Likehook. Además, el soporte de cada clado fue evaluado mediante el método Bootstrap.

El análisis filogenético de doce muestras evaluadas agrupa las secuencias en dos genotipos conocidos de DENV2; dos muestras de Madre de Dios se agrupan en el clado del genotipo América/Asia que circula en la región Loreto desde finales del año 2010 y está ampliamente distribuido desde entonces en el Perú. Las otras diez muestras se agrupan en el clado del genotipo Cosmopolitan, junto con cepas de Bangladesh ⁽⁴⁾ y China ⁽⁵⁾, como se muestra en el árbol filogenético (Figura 1).

Figura 1. Árbol filogenético construido con el algoritmo Maximum Likehook que muestra la homología del DNEV-2 con el genotipo Cosmopolitan del brote de Madre de Dios-Perú, 2019. El valor Bootstrap (>70) es representado en la raíz de cada clúster.

Estos resultados demuestran la introducción de un «nuevo genotipo» de DENV2 que deriva del genotipo Cosmopolitan, con alta homología con las cepas reportadas en Bangladesh. Estos resultados fueron confirmados por el Centers for Disease Control and Prevention, Dengue Branch-Puerto Rico. Este genotipo Cosmopolitan está circulando en otras partes del mundo como en India ⁽⁴⁾, África ⁽⁶⁾, China ⁽⁵⁾, Océano Índico y recientemente en 2019 en la Polinesia Francesa ⁽⁷⁾. Hasta donde sabemos, este es el primer reporte de un brote causado por un genotipo Cosmopolitan en la región de las Américas. El primer informe de una cepa cosmopolitan detectada en las Américas se describió a finales de los años 90, en la península de Yucatán, en México, pero solo se estudió un aislado viral y hasta ahora no se ha detectado este genotipo en la región de las Américas. La determinación del nuevo genotipo fue hecha a partir de aislamientos virales y retrospectivamente hubo limitaciones para tener información clínica detallada. 

Este hallazgo destaca la necesidad de activar la vigilancia genómica de manera rutinaria en el laboratorio que incluya información clínico-epidemiológica. Siendo necesario realizar la vigilancia genómica de los aislamientos de DENV 2 procedentes de otras zonas endémicas del país para tener una visión más amplia de la circulación, evaluar la ruta de entrada y la dispersión de este nuevo genotipo en las Américas. Adicionalmente, el estudio debe complementarse para determinar si este nuevo genotipo está asociado o no con casos graves de dengue.

Agradecimientos: al personal del Laboratorio de Referencia de Madre de Dios y al Blgo. Edwin Tineo por el manejo de las muestras; al personal del Laboratorio de Referencia Nacional de Enfermedades Metaxénicas Virales y al Blgo. Adolfo Marcelo y a la Lic. Nancy Susy Merino; por el procesamiento de las muestras; a los biólogos Omar Cáceres y Henry Baylón del Laboratorio de Referencia Nacional de Biología Molecular por el apoyo con el análisis filogenético y al Dr. Oscar Escalante del Centro Nacional de Salud Pública del Instituto Nacional de Salud, por su opinión sobre el análisis filogenético; a la Dra. Karim Pardo, directora ejecutiva de la DEPCEM-MINSA y al Dr. Manuel Espinoza por su apoyo con la parte clínica en la intervención del brote. Al Blgo. Fernando Chapilliquen del Centro Nacional de Epidemiología Prevención y Control de Enfermedades -CDC-Perú, por los aportes epidemiológicos. Nuestro agradecimiento especial a la Dra. Leticia Franco y al Dr. Jairo Mendez por su opinión sobre el análisis filogenético y por vincularnos con el proyecto de Vigilancia Genómica del Dengue (ViGenDA) de la Red de Laboratorios de Arbovirus (RELDA) de la OPS y a los Doctores Gilberto Santiago y Jorge Muñoz del Centers for Disease Control and Prevention, Dengue Branch - Puerto Rico, por la confirmación de los resultados.

Contribuciones de los autores: conceptualizaron el estudio: MPG, CC y CM. Diseñaron la metodología y condujeron el estudio: MPG y CC. Analizaron los datos: CP, DF y MPG. Redactaron el borrador:  MPG y CC. Redactaron y revisaron la versión final: MPG, CC, CP y DF.

Conflicto de interés: Ninguno.

Financiamiento: Instituto Nacional de Salud.

Referencias bibliográficas

1. Ministerio de Salud. Sala de situación virtual, Dengue. [Internet]. Lima: Centro Nacional de Epidemiología y control de Enfermedades, MINSA; 2019 [Citado el 5 de diciembre 2019]. Disponible en: https://www.dge.gob.pe/portal/index.php?option=com_content&view=article&i-d=14&Itemid=154.

2. Cabezas C, Fiestas V, García-Mendoza M, Palomino M, Mamani E, Donaires F. Dengue en el Perú: a un cuarto de siglo de su reemergencia. Rev Peru Med Exp Salud Publica. 2015;32(1):146-56.

3. Santiago GA, González GL, Cruz-López F, Muñoz-Jordan JL. Development of a standardized Sanger-based method for partial sequencing and genotyping of dengue viruses.  J Clin Microbiol. 2019 Mar 28;57(4):e01957-18. doi: 10.1128/JCM.01957-18.

4. Suzuki K, Phadungsombat J, Nakayama EE, Saito A, Egawa A, Sato T, et al. Genotype replacement of dengue virus type 3 and clade replace-ment of dengue virus type 2 genotype Cosmopolitan in Dhaka, Bangladesh in 2017. Infect Genet Evol. 2019;75:103977. doi: 10.1016/j.meegid.2019.103977.

5. Yenamandra SP, Koo C, Chiang S, Lim HSJ, Yeo ZY, Ng LC, et al. Evolution, heterogeneity and global dispersal of cosmopolitan genotype of Dengue virus type 2. Sci Rep. 2021;11(1):13496. doi: 10.1038/s41598-021-92783-y.

6. Hill SC, Neto de Vasconcelos J, Granja B, Thézé J, Jandondo D, Neto Z, et al. Early Genomic Detection of Cosmopolitan Genotype of Dengue Virus Serotype 2, Angola, 2018. Emerg Infect Dis. 2019;25(4):784-787. doi: 10.3201/eid2504.180958.

7. Aubry M, Mapotoeke M, Teissier A, Paoaafaite T, Dumas-Chastang E, Giard M, et al. Dengue virus serotype 2 (DENV-2) outbreak, French Polynesia, 2019. Euro Surveill. 2019;24(29):1900407. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2019.24.29.1900407.

Citar como: García MP, Padilla C, Figueroa D, Manrique C, Cabezas C. Emergencia del genotipo Cosmopolitan del virus dengue serotipo 2 (DENV2) en Madre de Dios, Perú, 2019. Rev Peru Med Exp Salud Publica. 2022;39(1):126-8. doi: https://doi.org/10.17843/rpmesp.2022.391.10861.

Correspondencia: María Paquita García Mendoza; mariapaquitagarcia@gmail.com

Recibido: 21/02/2022
Aprobado:  09/03/2022  
En línea: 17/03/2022