Microbiological and molecular characterization of antimicrobial resistance in uropathogenic Escherichia coli from Peruvian public hospitals

Authors

  • Pool Marcos-Carbajal Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, EP Medicina Humana, Universidad Peruana Unión, Lima, Perú.Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.Biólogo; magíster en Biología Molecular https://orcid.org/0000-0002-7741-0337
  • Guillermo Salvatierra Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. médico veterinario; magíster en Biología Molecular https://orcid.org/0000-0002-6887-2599
  • José Yareta Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, EP Medicina Humana, Universidad Peruana Unión, Lima, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-8909-1724
  • Jimena Pino Laboratorio de Microbiología, Hospital Antonio Lorena, Cuzco, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0003-4563-5459
  • Nancy Vásquez Laboratorio de Microbiología, Hospital Antonio Lorena, Cuzco, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0001-7311-1244
  • Pilar Diaz Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública San Martín, Tarapoto, Perú. técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-0929-4602
  • Isabel Martínez Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Tumbes, Tumbes, Perú. técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-5126-7480
  • Percy Asmat Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública, La Libertad, Trujillo, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0003-3377-6713
  • Carlos Peralta Área de Microbiología, IPRESS Jorge Chávez, Madre de Dios, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-9605-8324
  • Caridad Huamani Área de Microbiología, IPRESS Jorge Chávez, Madre de Dios, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-6597-1671
  • Alexander Briones Servicio de Microbiología, Hospital Regional de Loreto, Iquitos, Perú. tecnólogo médico https://orcid.org/0000-0003-4849-6466
  • Manuel Ruiz Área de Microbiología, Clínica Adventista Ana Stahl, Iquitos, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-0902-8937
  • Nicomedes Laura Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Huancavelica, Huancavelica, Perú.técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-6413-3270
  • Álvaro Luque Área de Microbiología, Clínica Americana Juliaca, Juliaca, Perú. Biólogo
  • Leonel Arapa Laboratorio de Microbiología, Hospital Carlos Monge Medrano, Juliaca, Perú. Biólogo
  • Pablo Tsukayama Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. Biólogo; doctor en Microbiología Molecular.

DOI:

https://doi.org/10.17843/rpmesp.2021.381.6182

Keywords:

Escherichia coli, Drug Resistance, beta-Lactam Resistance, Urologic Diseases, Peru

Abstract

We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the blaTEM, blaCTX-M, blaSHV and blaPER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The blaTEM gene was the most frequent (31,4%), followed by blaCTX-M (18,6%) and blaSHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.

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Published

2021-02-14

Issue

Section

Brief Report

How to Cite

1.
Marcos-Carbajal P, Salvatierra G, Yareta J, Pino J, Vásquez N, Diaz P, et al. Microbiological and molecular characterization of antimicrobial resistance in uropathogenic Escherichia coli from Peruvian public hospitals. Rev Peru Med Exp Salud Publica [Internet]. 2021 Feb. 14 [cited 2024 May 30];38(1):119-23. Available from: https://rpmesp.ins.gob.pe/index.php/rpmesp/article/view/6182

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