Caracterización microbiológica y molecular de la resistencia antimicrobiana de Escherichia coli uropatógenas de hospitales públicos peruanos

Pool Marcos-Carbajal; Guillermo Salvatierra; José Yareta; Jimena Pino; Nancy Vásquez; Pilar Diaz; Isabel Martínez; Percy Asmat; Carlos Peralta; Caridad Huamani; Alexander Briones; Manuel Ruiz; Nicomedes Laura; Álvaro Luque; Leonel Arapa; Pablo Tsukayama

doi:10.17843/rpmesp.2021.381.6182

Authors

Pool Marcos-Carbajal Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, EP Medicina Humana, Universidad Peruana Unión, Lima, Perú.Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú.Biólogo; magíster en Biología Molecular https://orcid.org/0000-0002-7741-0337
Guillermo Salvatierra Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. médico veterinario; magíster en Biología Molecular https://orcid.org/0000-0002-6887-2599
José Yareta Laboratorio de Investigación en Biología Molecular, EP Medicina Humana, Universidad Peruana Unión, Lima, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-8909-1724
Jimena Pino Laboratorio de Microbiología, Hospital Antonio Lorena, Cuzco, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0003-4563-5459
Nancy Vásquez Laboratorio de Microbiología, Hospital Antonio Lorena, Cuzco, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0001-7311-1244
Pilar Diaz Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública San Martín, Tarapoto, Perú. técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-0929-4602
Isabel Martínez Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Tumbes, Tumbes, Perú. técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-5126-7480
Percy Asmat Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional Salud Pública, La Libertad, Trujillo, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0003-3377-6713
Carlos Peralta Área de Microbiología, IPRESS Jorge Chávez, Madre de Dios, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-9605-8324
Caridad Huamani Área de Microbiología, IPRESS Jorge Chávez, Madre de Dios, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-6597-1671
Alexander Briones Servicio de Microbiología, Hospital Regional de Loreto, Iquitos, Perú. tecnólogo médico https://orcid.org/0000-0003-4849-6466
Manuel Ruiz Área de Microbiología, Clínica Adventista Ana Stahl, Iquitos, Perú. Biólogo https://orcid.org/0000-0002-0902-8937
Nicomedes Laura Servicio de Microbiología, Laboratorio de Referencia Regional de Salud Pública Huancavelica, Huancavelica, Perú.técnico en laboratorio https://orcid.org/0000-0002-6413-3270
Álvaro Luque Área de Microbiología, Clínica Americana Juliaca, Juliaca, Perú. Biólogo
Leonel Arapa Laboratorio de Microbiología, Hospital Carlos Monge Medrano, Juliaca, Perú. Biólogo
Pablo Tsukayama Laboratorio de Genómica Microbiana, Universidad Peruana Cayetano Heredia, Lima, Perú. Biólogo; doctor en Microbiología Molecular.

DOI:

https://doi.org/10.17843/rpmesp.2021.381.6182

Keywords:

Escherichia coli, Drug Resistance, beta-Lactam Resistance, Urologic Diseases, Peru

Abstract

We characterized the antimicrobial resistance of 70 Escherichia coli isolates obtained from patients with a urinary tract infection (UTI) from 8 public hospitals in Peru. Resistance profiles were identified using the automated MicroScan® system. A standard polymerase chain reaction was used for the detection of the blaTEM, blaCTX-M, blaSHV and blaPER genes. The 65.7% (46/70) of the isolates presented a multidrug-resistant phenotype and 55.7% (39/70) were extended-spectrum beta-lactamases producers. High levels of resistance were detected for ampicillin (77,1%), ciprofloxacin (74,3%), trimethoprim/sulfamethoxazole (62,9%), cefepime (57,1%), and cefuroxime (57,1%). The blaTEM gene was the most frequent (31,4%), followed by blaCTX-M (18,6%) and blaSHV (2,9%) genes. These results show high resistance levels to antimicrobials of clinical use in E. coli isolates from hospital UTI patients in Peru.