Resistoma y genómica comparativa de aislados clínicos de Escherichia coli diarreogénica en Lima, Perú

Willi Quino, Orson Mestanza, Junior Caro-Castro, Carmen Verónica Hurtado, Ronnie G. Gavilán

Resumen


Con el objetivo de describir las características genómicas relacionadas con la resistencia antimicrobiana
y genómica comparativa de Escherichia coli diarreogénica (DEC), se sometieron a secuenciamiento
genómico catorce aislamientos de DEC del banco de cepas del Instituto Nacional de Salud (INS). Las
secuencias obtenidas se analizaron mediante procedimientos bioinformáticos a fin de buscar genes de resistencia
microbiana y regiones genéticas relacionadas con patotipos y filogrupos. Se detectaron diversos
determinantes de resistencia antimicrobiana, se destaca la producción de betalactamasas y mutaciones
asociadas a la resistencia a quinolonas. Además, se observaron aislamientos de un mismo patotipo agrupados
en distintos filogrupos. El análisis de genómica comparativa mostró un mayor número de genes
ortólogos en aislamientos que pertenecían al mismo patotipo y filogrupo. Sobre la base de lo estudiado,
los aislamientos de DEC en Lima, Perú, presentan resistencia a múltiples fármacos, y se detectaron varios
patotipos y filogrupos con diversidad molecular y filogenética.


Palabras clave


Escherichia coli; Resistencia a Medicamentos; Filogenia; Genómica

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DOI: https://doi.org/10.17843/rpmesp.2020.374.5240

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