Rapid spread of the emerging cosmopolitan genotype of dengue virus serotype 2, and expansion of dengue virus serotype 1 genotype V in Peru

Henri Bailon; Víctor Jimenez; Marco Galarza; Princesa Medrano; Orson Mestanza; Dana Figueroa; Wendy Lizarraga; Iris Silva; Luren Sevilla; Verónica Hurtado; Vanessa Izarra; Carlos Padilla; Luis Barcena; Omar Caceres; Susy Merino; Adolfo Marcelo; Nora Ruiz; Hapuarachchige Chanditha Hapuarachchii; César Cabezas Sánchez; María P. García

doi:10.17843/rpmesp.2024.414.13898

Authors

Henri Bailon Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0002-9593-6092
Víctor Jimenez Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0001-6547-6999
Marco Galarza Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0002-6547-2354
Princesa Medrano Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0003-4126-7038
Orson Mestanza Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0001-7268-0496
Dana Figueroa Laboratorio Nacional de Referencia de Enfermedades Metaxénicas y Zoonosis Virales, CNSP-INS, Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0003-4483-1087
Wendy Lizarraga Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0003-2595-5674
Iris Silva Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0001-7290-9254
Luren Sevilla Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0002-9940-1036
Verónica Hurtado Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0003-3667-6806
Vanessa Izarra Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0002-9220-6270
Carlos Padilla Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0002-0562-0431
Luis Barcena Área de Innovación y Desarrollo (Equipo de Vigilancia Genómica), Centro Nacional de Salud Pública (CNSP), Instituto Nacional de Salud (INS), Lima, Perú https://orcid.org/0000-0001-8776-8888
Omar Caceres Laboratorio Nacional de Referencia de Virus Inmunoprevenibles, CNSP-INS, Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0003-1529-2475
Susy Merino Laboratorio Nacional de Referencia de Enfermedades Metaxénicas y Zoonosis Virales, CNSP-INS, Lima, Perú https://orcid.org/0000-0002-4935-063X
Adolfo Marcelo Laboratorio Nacional de Referencia de Enfermedades Metaxénicas y Zoonosis Virales, CNSP-INS, Lima, Perú https://orcid.org/0000-0002-0043-5819
Nora Ruiz Laboratorio Nacional de Referencia de Virus Inmunoprevenibles, CNSP-INS, Lima, Perú https://orcid.org/0000-0001-6956-6342
Hapuarachchige Chanditha Hapuarachchii División de Microbiología y Epidemiología Molecular, Instituto de Salud Medioambiental, Agencia Nacional de Medio Ambiente, Singapur https://orcid.org/0000-0001-7079-8538
César Cabezas Sánchez Instituto Nacional de Salud, Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0001-5120-0713
María P. García Laboratorio Nacional de Referencia de Enfermedades Metaxénicas y Zoonosis Virales, CNSP-INS, Lima, Perú. https://orcid.org/0000-0002-2185-5038

DOI:

https://doi.org/10.17843/rpmesp.2024.414.13898

Keywords:

Dengue Virus, Dengue virus type 1, Dengue virus type 2, E-glycoprotein, Genotype, Peru

Abstract

Objectives. This study aimed to evaluate the prevalence and distribution of dengue virus genotype V serotype 1 (DENV-1) and cosmopolitan genotype serotype 2 (DENV-2) in Peru between 2019 and 2022. Materials and methods. The envelope (E) gene region was amplified from 79 serum samples by polymerase chain reaction (PCR) and sequenced by next-generation sequencing (NGS) technology. The obtained sequences were subsequently analyzed with bioinformatics tools. Results. The study generated envelope gene sequences of DENV-1 and DENV-2 serotypes. Our study revealed a rapid dispersal and wide distribution of the cosmopolitan DENV-2 genotype in several regions of Peru in 2022, as well as the spread of DENV-1 genotype V to new Peruvian regions, along with the cosmopolitan DENV-2 genotype. Conclusions. Our findings suggest the urgent need to strengthen epidemiological and genomic surveillance systems to understand and control the spread of circulating DENV genotypes in Peru. This will allow a more rapid response, as well as the monitoring of its potential dissemination to other countries in the Americas.

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